De fotocollectie van het Zuid-Afrika Huis bestaat uit ruim 4800 foto’s. In de collectie zijn vele afbeeldingen van personen, aardrijkskundige onderwerpen, flora en fauna en culturele aard te zien. Daarnaast hebben de foto’s vooral een geschiedkundig karakter. De collectie laat de geschiedenis van Zuid-Afrika in de afgelopen 125 jaar zien en dan met name de Nederlands - Zuid-Afrikaanse betrekkingen.

Een belangrijke deelcollectie zijn de foto’s van de Anglo-Boerenoorlog (1899-1902). Hiervan wordt gezegd dat het de eerste oorlog is die met behulp van foto’s is gedocumenteerd.